Effectivement, lorsqu'on appuie sur Maj+Entrée, on fait un retour ligne, tout en restant dans le même paragraphe. Donc, si le paragraphe est justifié, cette ligne le sera aussi.
Voici la solution, pour chaque version :
Word 2013 et ultérieur
Onglet Fichier, Options, Options avancées, Options de mise en page (tout en bas), cocher l'option "Ne pas étirer les espaces des lignes finissant par MAJ+RETOUR"
Dans la liste déroulante située en face de Options de mise en page, choisissez Tous les nouveaux documents pour que cette option soit affectée à chaque nouveau document.